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生物超算
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生物超算  
 
生物超算简介

  生物计算组配有高性能计算集群,面向中科院内外前瞻研究、基础研究和交叉研究领域中重要项目的研究和探索提供支撑服务。 

   生物超算服务器集群拥有72个计算节点(包含2个胖节点),计算能力达到12.6万亿次/秒;搭建了120TB的先进高性能集群NAS计算存储和192TB高速测序存储;配备多个序列数据库和PerlRmatlabJAVA等开发语言环境,形成了以高性能计算、高通量基因组学数据分析、序列拼接、表观遗传学、基因芯片分析、小RNA分析、转录组分析为核心的分析路线和体系,并自主研发了inGAP等计算生物学数据处理软件。 

  一、生物超算服务器资源描述: 

  生物超算服务器可为用户提供生物信息分析所需的计算资源,以及数据计算分析的生物超算服务。用户可以通过生物超算服务器使用生物信息软件和常用数据库完成生物信息学、计算生物学等计算任务。例如基因序列分析、序列拼接、基因表达谱数据分析、大尺度的生态学数据分析等工作。 

  二、配套仪器: 

  1. 所有计算节点均安装linux Redhat操作系统,配备生物信息常用软件与数据库; 

  2. 30台深圳宝德刀片式服务器:   CPU总数:2*4*30=240  总内存:16GB*30=480GB 

  3. 40台曙光CB85刀片式服务器:   CPU总数:24*40=960   总内存: 48GB*40=1920GB 

  4. 大内存节点:1Dell R910 机架式服务器(64核心,512GB内存) 

          1IBM x3850X564核心,2TB内存) 

  5. 存储系统:  120TB的先进高性能集群NASPanasas 11)计算存储 

                192TB高速测序存储(同有与宝德磁盘阵列) 

  三、仪器图片: 

  1. 高性能计算刀片(曙光、宝德、戴尔、IBM 

          

  2. 高性能集群NAS存储与测序仪专用存储(Panasas、同有、宝德) 

        

 

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